អគ្គនាយកដ្ឋានធនធានរ៉ែមានតួនាទីក្នុងការដឹកនាំ គ្រប់គ្រង និងអភិវឌ្ឍការងារពាក់ព័ន្ធនឹងផែនការសេដ្ឋកិច្ចធនធានរ៉ែ ភូគព្ភសាស្ត្រ និងរ៉ែ ឧស្សាហកម្មរ៉ែ រ៉ែខ្សាច់សំណង់ ការដ្ឋានយកថ្មសំណង់ និងការត្រួតពិនិត្យប្រតិបត្តិការរ៉ែដើម្បីអនុលោមតាមគោលនយោបាយរបស់រាជរដ្ឋាភិបាល និងក្របខណ្ឌច្បាប់ និងបទប្បញ្ញត្តិដែលមានស្រាប់។ តួនាទីទាំងអស់គឺស្របតាមចក្ខុវិស័យរបស់រាជរដ្ឋាភិបាលកម្ពុជាសម្រាប់វិស័យរ៉ែ ដែលមានគោលដៅ «អភិវឌ្ឍធនធានរ៉ែដើម្បីផលសេដ្ឋកិច្ច និងសង្គម ដោយមានការគិតគូរពីអភិបាលកិច្ចល្អ និងការទំនួលខុសត្រូវលើបរិស្ថានផងដែរ»។ ការងារនេះត្រូវបានអនុវត្តតាមរយៈនាយកដ្ឋានជំនាញដូចខាងក្រោម៖
- នាយកដ្ឋានផែនការសេដ្ឋកិច្ចធនធានរ៉ែ
- នាយកដ្ឋានភូគព្ភសាស្ត្ររ៉ែ
- នាយកដ្ឋានឧស្សាហកម្មអាជីវកម្មធនធានរ៉ែ
- នាយកដ្ឋានការដ្ឋានរ៉ែថ្មសំណង់
- នាយកដ្ឋានការដ្ឋានរ៉ែខ្សាច់សំណង់
- នាយកដ្ឋានត្រួតពិនិត្យប្រតិបត្តិការរ៉ែ